選育優質吳郭魚品系，培育臺灣鯛 (Oreochromis niloticus)、紅尼羅魚 (Oreochromis spp.) 種群及商用養殖魚苗的生產，運用生物科技育種並有效管理核心種魚，台灣鯛品系種原建立及量產技術已達到國際水準以上。
積極研發系統化繁養殖設施，改良傳統養殖模式，以達到節能減碳、減少勞力、降低養殖成本及環境永續等目的。
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